Qualification

La pureté et l’intégrité des acides nucléiques est l’élément principal de la réussite des analyses génomiques ultérieures. L’ARN doit être le moins dégradé possible, et sans contamination ADN et protéique. L’ADN quant à lui doit avoir une bande majoritaire à 15 – 30 Kb, sans contamination ARN et protéique.

Notre plateforme détermine la qualité des acides nucléiques grâce aux méthodes suivantes :

  • Le spectrophotomètre ND-1000 : la mesure de l’absorbance définie la pureté et le dosage en ARN et ADN.
  • Le spectrofluorimètre ND-3300 : ce moyen de dosage plus spécifique permet d’avoir la concentration précise en ARN et ADN même en présence d’une contamination.
  • Le Bioanalyseur 2100 Expert et l’électrophorèse sur gel d’agarose: évaluation du profil electrophorétique pour déterminer l’integrité des ARN (ratio 28S/18S et RIN) et des ADN (bande majoritaire à 15 – 30 Kb).

Pour chacune de ces méthodes, des critères de qualification ont été définis, basés sur la littérature et notre expérience (plus de 10500 ARN, 700 miRNA and 6900 ADN ont été évalués entre 2000 et 2011).