Les échantillons de cellules et tissus tumoraux sont obtenus avec le consentement éclairé des patients. Les prélèvements sont réalisés au bloc opératoire et sont immédiatement cryoconservés à – 80° C.

Toutes les informations relatives aux patients sont anonymisées et transmises par les centres de soins.Toutes les annotations relatives au suivi clinique, ainsi que les résultats des différents tests biologiques et génétiques conduits sur les patients, sont inclus dans une base de données avec accès sécurisé (Annotator®).

Cette base de données du programme CIT contient également les données générées par les différentes plate-formes technologiques et les résultats d’analyses. A chaque étape du processus d'intégration des données, l'ensemble des informations est contrôlé et standardisé.

La complétude et la consistance des informations sont vérifiées. Les annotations sont alors recodées selon des standards internationaux et internes. Ainsi, les analyses peuvent être conduites sur plusieurs projets avec l’assurance de la comparabilité des annotations. 

En lire plus sur le taux de remplissage dans la base de données Annotator®...

En lire plus sur la curation et la standardisation des annotations...