Le programme

Initié en 2000 par la Ligue Nationale Contre le Cancer sur proposition du Pr François Sigaux, le programme de recherche Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT) vise à caractériser de façon exhaustive les altérations du génome à l’origine des cancers. L’analyse à haut débit de ces anomalies, grâce aux technologies « omiques », permet de mieux comprendre la diversité des tumeurs et les mécanismes à l’origine de chaque cancer. Ces travaux constituent une base pour permettre une médecine de précision, adaptée aux caractéristiques génomiques de chaque tumeur.

Le programme CIT dispose de 3 atouts majeurs :

  • un réseau national de chercheurs et cliniciens permettant un accès aux ressources biologiques de larges cohortes de patients pour de nombreux types de cancers. Ces spécialistes de la maladie sont moteurs des projets s’inscrivant dans le cadre du programme CIT et suivent activement leur déroulement.
  • une plateforme technologique dédiée à l’extraction des acides nucléiques (ADN, ARN, …) pour chaque projet et à leur transfert vers les plateformes de profilage / séquençage. Ceci assure une standardisation du protocole pour l’ensemble des échantillons tumoraux étudiés par le programme. Les données cliniques associées sont également collectées et contrôlées selon un protocole rigoureux mis en place par le programme.
  • une équipe de bio-analystes maîtrisant à la fois l’ensemble des outils et méthodes propres à l’analyse des données biologiques, ainsi que les fondamentaux de la biologie des cancers. Cette équipe prend en charge l’analyse exploratoire des données génomiques obtenues en vue d’une dissection moléculaire des tumeurs.

L’analyse combinée des anomalies chromosomiques, de l’expression des gènes, du méthylome, du miRnome et de l’exome, permet d’obtenir une vision intégrée du fonctionnement des cellules cancéreuses.

Plus de 14,000 échantillons, de tous types de cancer, ont déjà été analysés par l’équipe et plus de 60 projets de recherche ont été menés dans le cadre du programme CIT. Ces projets ont conduit à de nombreuses publications dans des revues internationales et leurs résultats sont régulièrement présentés dans des congrès internationaux.

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